水质自动监测系统分为地表水和废水监测系统，地表水水质自动监测系统包括提水系统、配水系统、水质自动监测仪、自动操作控制系统、数据采集及传输。
主要功能：水质自动监测系统可以自动、连续地测定多个项目，做到及时掌握水质变化情况，控制污染物的总量排放，为实施污染物总量控制制度提供技术支持。